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从GPRC5D看CAR-T靶点的发现与研究

CAR-T靶点发现与研究

今年2月,驯鹿医疗在Clinicaltrails.org注册了以GPRC5D为靶点的CAR-T临床一期研究,旨在初步观察用于复发性/难治性多发性骨髓瘤或浆细胞白血病患者的疗效。

 

目前在Clinicaltrails.org以及中国临床试验注册中心(ChiCTR)注册的GPRC5D-CAR-T临床研究共有5项,我国有3项,分别由驯鹿医疗、原启生物、徐州医科大学附属医院发起。其余两项分别由纪念斯隆-凯特琳癌症中心、强生发起,其中,强生GPRC5D/CD3双抗研究已经进入到临床二期阶段[1][2]。

 

本文结合纪念斯隆-凯特琳癌症中心于2019年发表在Science Translational Medicine的文献GPRC5D is a target for the immunotherapy of multiple myeloma with rationally designed CAR T cells来简要讲述CAR-T靶点的发现过程[3]。

 

一、背景介绍

1CAR-T研究中的靶点分类

 

CAR-T细胞通过特异性识别肿瘤细胞表面的抗原,对肿瘤细胞进行靶向杀伤作用,因此靶点抗原的选择对CAR-T对研究极为重要。

▷肿瘤特异性抗原:在正常组织中不表达,仅在肿瘤细胞表面特异性表达,是最理想的抗原靶点。然而,这种理想抗原数量稀有。

▷肿瘤相关抗原:在正常组织中低表达,在肿瘤细胞表面过度表达,是目前研究最多的靶点。

 

2G蛋白偶联受体C5家族亚型D

 

G蛋白偶联受体C5家族亚型D(GPRC5D)是一种孤儿受体,其配体和信号传导机制尚未确定,结构上属于7次跨膜蛋白。纪念斯隆-凯特琳癌症中心的研究证明了GPRC5D在多发性骨髓瘤(MM)细胞上表达,除此之外,GPRC5D也在毛囊上表达,由于毛囊属于免疫豁免部位,使GPRC5D成为潜在靶点[3]。

CAR-T靶点发现与研究

Figure 1 GPRC5D结构示意图[4]。

注:孤儿受体(Orphan Receptor)是指与其它已确认的受体结构明显相似,但其内源配体还未发现的受体。

 

3多发性骨髓瘤

 

多发性骨髓瘤(MM)是一种恶性浆细胞病,其肿瘤细胞起源于骨髓中的浆细胞。MM发病率估计为2~3/10万,男女比例为1.6:1,大多患者年龄大于40岁。其特征为骨髓浆细胞异常增生伴有单克隆免疫球蛋白或轻链(M蛋白)过度生成,极少数患者可以是不产生M蛋白的未分泌型MM。多发性骨髓瘤常伴有多发性溶骨性损害、高钙血症、贫血、肾脏损害。由于正常免疫球蛋白的生成受抑,因此容易出现各种细菌性感染。

CAR-T靶点发现与研究

Figure 2 多发性骨髓瘤示意图[5]。

 

二、CAR-T靶点的发现过程

1GPRC5D在MM细胞上特异性表达

 

为了验证GPRC5D的特异性表达,纪念斯隆-凯特琳癌症中心评估了1000种以上的恶性肿瘤细胞系,结果表明GPRC5D在多发性骨髓瘤细胞上表达,而在其他肿瘤细胞系中无实质性的表达。

CAR-T靶点发现与研究

Figure 3 恶性细胞系中GPRC5D的mRNA 表达( n = 1036)。DLBCL:弥漫性大 B 细胞淋巴瘤;CML:慢性粒细胞白血病;ALL:急性淋巴细胞白血病;AML:急性髓性白血病;NSC:非小细胞肺癌。[3]

 

此外,在人体组织的评估中,GPRC5D 在除皮肤和骨髓样本以外的任何正常组织中均为低表达,在皮肤中表达不定;而在骨髓样本中,原发性恶性浆细胞和正常浆细胞的GPRC5D mRNA表达量比外周血B细胞中mRNA的表达量分别高出 1000 倍和 500 倍。

CAR-T靶点发现与研究

Figure 4 正常组织中GPRC5D的mRNA 表达。[3]

 

2GPRC5D表达与BCMA表达是独立的

 

使用BCMA作为多发性骨髓瘤的靶点已经成熟,2021年3月,BMS/蓝鸟生物共同研发,以BCMA为靶点的Abecma由FDA批准上市。因此,验证GPRC5D的表达与BCMA无关十分重要。纪念斯隆-凯特琳癌症中心使用免疫组化(IHC)验证分析了83个多发性骨髓瘤患者的骨髓样本,通过对比每个样本中GPRC5D和BCMA表达的比例,得出结论GPRC5D 表达与 BCMA 表达无关(R2 = 0.156)。

CAR-T靶点发现与研究

 

CAR-T靶点发现与研究

Figure 5 A. 原发性骨髓瘤骨髓 CD138、BCMA 和 GPRC5D 的代表性免疫染色。D. CD138+细胞上 BCMA 和 GPRC5D 表达的相关性;R2 = 0.156。[3]

 

3scFv & CAR分子设计

 

噬菌体展示技术(Phage Display)将目标基因插入噬菌体衣壳壳蛋白的基因中,使目标基因表达并与噬菌体颗粒的衣壳蛋白融合,在基因型和表型之间建立联系。然后通过组装数百万个转基因噬菌体建立噬菌体展示库,用于大规模研究分子相互作用,如蛋白质-蛋白质、蛋白质-肽和蛋白质-DNA相互作用,并选择对特定靶标亲和力最高的分子。

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Figure 6 丝状噬菌体M13结构示意图[6]。目标基因根据序列长短通常表达于pⅢ或pⅧ。

 

纪念斯隆-凯特琳癌症中心使用噬菌体展示文库鉴定了 7 个 GPRC5D 特异性(与MM细胞特异性结合最高,但不与GPRC5D阴性细胞结合)单链可变片段 (scFv),并构建出42 种不同的CAR分子(每个scFv分别构建长、中、短3种铰链区(Hinge),以及VH/VL和VL/VH两种不同的方向,即每个scFv构建6种CAR分子),用于进一步的特异性筛选。结果表明,含有GPRC5D (109) 、具有VL/VH方向、拥有长铰链区的 CAR分子,对抗原暴露最敏感。

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Figure 7 D. 使用7种不同的scFv构建CAR分子的抗原依赖性信号传导(蓝色)与非抗原依赖性信号传导(橙色)。E. 含有GPRC5D (109) 、具有VL/VH方向、拥有长铰链区的 CAR分子对抗原最敏感,而且非抗原依赖性信号传导最弱。[3]

 

4下游验证试验

经由上面几轮鉴定,纪念斯隆-凯特琳癌症中心筛选出最佳CAR的分子结构,并构建CAR-T细胞,进行一系列的体内外药效分析、脱靶效应分析等,本文不再详细展开。

CAR-T靶点发现与研究

Figure 8 构建3种靶向CD19、BCMA、GPRC5D的CAR-T细胞,与多发性骨髓瘤细胞共孵育的体外杀伤结果,可见BCMA CAR-T和GPRC5D CAR-T对多发性骨髓瘤细胞的杀伤效果基本一致。[3]

CAR-T靶点发现与研究

Figure 9 构建靶向CD19、GPRC5D的CAR-T细胞,在多发性骨髓瘤小鼠模型中的活体成像监测结果。[3]

 

纪念斯隆-凯特琳癌症中心最终得出结论,在体外活性验证中,靶向GPRC5D的CAR-T细胞与靶向BCMA的CAR-T细胞表现出一致的杀伤能力;体内活性验证中,靶向GPRC5D的CAR-T细胞与靶向BCMA的CAR-T细胞对于清除肿瘤和延长生存期的表现一致。因此,GPRC5D是多发性骨髓瘤免疫治疗的另一有效靶点,并且在体内 BCMA 抗原逃逸复发模型中,靶向GPRC5D的CAR-T细胞依然具有抗肿瘤活性。

 

三、总结

本文通过对纪念斯隆-凯特琳癌症中心对GPRC5D研究的介绍,给大家讲解了CAR-T靶点发现的一般思路:

  1. 验证靶点的特异性,满足在靶细胞高表达,正常组织低表达;

  2. 筛选高亲和力的scFv;

  3. 由筛选出的scFv设计CAR分子结构,进一步分析和鉴定;

  4. 构建CAR-T细胞,进行体内外药效评估。

 

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CAR-T靶点发现与研究

 

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参考文献:

[1]https://clinicaltrials.gov/

[2]http://www.chictr.org.cn/

[3]Smith, E. L., Harrington, K., Staehr, M., Masakayan, R., Jones, J., Long, T. J., ... & Brentjens, R. J. (2019). GPRC5D is a target for the immunotherapy of multiple myeloma with rationally designed CAR T cells. Science translational medicine, 11(485), eaau7746.

[4]https://www.creative-biolabs.com/

[5]https://www.teresewinslow.com/

[6]https://www.proteogenix.science/

 

关于赛业

赛业生物成立于2006年,是一家借助AI赋能药物研发的创新性CRO公司。目前员工人数超900名,总规模超40000平方米,在中国广州、苏州、固安设立有全资子公司,在成都、北京、上海、武汉、长沙等地设有办事处,在美国Santa Clara和日本东京设有分公司。过去十余年,赛业生物依托于品系丰富的基因编辑小鼠资源库、高效智能化的大小鼠定制平台、规模化的大小鼠快速繁育平台以及严格质控的无菌鼠技术服务平台,在模式动物基因编辑技术方面走在行业前沿,同时也积累了大量的生物信息及基因编辑方面的数据。结合在人工智能领域的深度探索,赛业生物可为从事基因治疗和细胞治疗的研究者提供一站式整体解决方案,包括AI靶点筛选与功能研究、动物模型构建、治疗性载体设计与优化、病毒包装以及药理药效学研究等全流程服务,助力提高基因治疗和细胞治疗基础研究的临床转化效率。

 

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