致病性突变研究资助计划第二期：免费AI生信分析服务与科研奖励计划-赛业生物

临床研究人员获得临床样本后，经过二代测序和GWAS分析（全基因组关联分析）可产生大量SNP候选位点，然而要验证这些位点与临床表现的关系，必须回到体内实验。模拟人类疾病突变的点突变小鼠是体内研究的必备工具，在构建模型前，需要更精细化地研究突变位点才能构建精准表征疾病发病机制的模型。为助力致病性突变研究，赛业生物联合清华珠三角研究院人工智能中心发起了“致病性突变研究资助计划”，该计划第一期自启动以来，得到了广大研究人员的积极参与，第一期活动详情和入选名单可点击这里查看。

随着第一期资助计划的圆满落幕，致病性突变研究资助计划第二期正式启动！我们特邀人工智能创新中心的生信专家团队，为提交申请的用户免费提供深度生信分析服务，帮助研究者降低研发试错成本，从而快速制定研究路线，开展针对疾病致病基因的科学研究和药物发现工作。此外，赛业生物还可提供从细胞基因表达调控与功能验证、小鼠疾病模型构建、药物药效评价分析的全流程服务。欢迎点击下方提交申请表单或拨拨打400-680-8038或邮件至info@cyagen.com或点击侧边栏在线咨询联系我们。

活动内容：

2024年3月18日-4月30日

活动对象：

全国科研终端客户

活动内容

1. 免费AI生信分析服务

点击下方“免费申请”按钮成功提交有效申请信息，即可享受由生信专家提供的深度生信分析服务，有助于您更全面、深入地评估研究成果，降低研发试错成本，从而快速制定研究路线，开展针对疾病致病基因的科学研究和药物发现工作。

2.「科研奖励计划」

参与科研奖励计划，为您的研究助力！在发表论文时，请注明您使用的小鼠来源于赛业生物（Cyagen），或数据分析引用RDDC：即RDDC罕见病数据库 (rddc.tsinghua-gd.org)，就有机会获得精美奖品。

强大的AI算法赋能基因编辑项目

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RNA剪接预测工具（RNA Splicer）：
AI预测助力mRNA异常剪接研究报告

点击下载

AI辅助预测的应用案例——杜氏肌营养不良

临床特征

杜氏肌营养不良（Duchenne Muscular Dystrophy, DMD）属于X连锁隐性遗传病，致病基因DMD是人类基因组中最大的基因（2.5 Mb）。60-65%的病例是由一个或多个DMD外显子的大量缺失引起疾病的发生；约20%的突变是由单核苷酸变异引起，包括移码突变、无义突变、错义突变和插入缺失突变。通常框内突变会导致不太严重的肌营养不良症，称为贝克尔肌营养不良症（Becker muscular dystrophy, BMD），而移码突变会导致更严重的DMD表型。患者样本采用全基因组测序，结果显示DMD基因有1个半合子突变：c.4675-2A>G突变导致发生异常剪接。

项目类型	详细信息
基因	DMD
染色体位置	chrX:32398799
转录本/外显子	NM_004006;Exon34
核苷酸/氨基酸	c.4675-2A>G
纯合/杂合	杂合
正常人频率	-
ACMG致病性分析	Pathogenic
疾病/表型（遗传方式）	杜氏肌营养不良（XLR），贝氏肌营养不良（XLR），扩张性心肌病3B型（XL）
变异来源	自发

表1. DMD患者全外显子测序结果

AI预测结果

使用罕见病数据中心（RDDC）开发的AI线上预测工具，即致病性突变预测工具（Patho Predict）和RNA剪接模型工具（RNA Splicer），进行突变致病性及RNA剪接的预测：

01结果显示该突变的致病性与患者表型相符

Probability	0.84
Prediction	Pathogenic
Gene Name	DMD
Chromosome	X

Coordinate	32380682
PHRED	35
Gene ID	1756
Consequence	Canonical splice

图1. 突变致病性预测模型预测结果

02致病的原因可能是突变引起的两种剪接异常方式，其一是发生了34号外显子跳跃；其二是基因组上丢失7个碱基（非三倍数），造成了移码继而发生提前终止。

图2. RNA剪接模型预测结果

验证结果

文献报道过DMD携带者中同样出现该位点的突变，并且产生了新剪接受体位点（Hofstra et al. 2004），文献结果与工具页面展示的结果一致。到目前为止，已经报道的DMD致病突变超过四千多种，使用RNA Splicer预测工具尝试对几十种影响DMD剪接的突变进行计算，AI模型计算的结果与报道结果高度一致。

服务优势