CRISPR新期刊:有效识别并区分CRISPR-Cas系统

日期: 2018年04月19日


    

导读:《The CRISPR Journal》是一份全新的开创性同行评审期刊,由Mary Ann Liebert Inc.出版,旨在介绍CRISPR杰出研究成果和各方面评论。下面,赛业小编为您推荐“CRISPR新期刊:有效识别并区分CRISPR-Cas系统”,详情如下:

 

CRISPR新期刊:有效识别并区分CRISPR-Cas系统


《The CRISPR Journal》是一份全新的开创性同行评审期刊,由Mary Ann Liebert Inc.出版,旨在介绍CRISPR杰出研究成果和各方面评论。


最新期刊公布了一项重要成果:研究人员研发出了一种新型CRISPRdisco自动化系统,能用于鉴定基因组组装中的CRISPR重复序列和cas基因。这一免费提供的软件提出了标准化的高通量分析方法,可以检测CRISPR重复序列并准确分析类别,类型和亚型。


CRISPRdisco由北卡罗来纳州立大学的Rodolphe Barrangou博士研发,文章标题为:CRISPRdisco: An Automated Pipeline for the Discovery and Analysis of CRISPR-Cas Systems。


在这篇文章中,研究人员也利用CRISPRdisco 在NCBI RefSeq数据库中,对2,777个完整基因组中的可能CRISPR-Cas系统进行鉴定和分类。


文章强调了能够区分完整和不完整的CRISPR系统的重要性,并确定潜在完整和功能性CRISPR-Cas in vivo系统与in silico CRISPR-Cas多样性之间的联系。


更重要的是,这个平台可以通过GitHub轻松获得,并且能帮助新手挖掘和了解各种基因组数据集中的CRISPR-Cas系统。


CRISPR Journal的执行编辑Kevin Davies博士说:“新的生物信息学工具,程序和数据库能帮助推动CRISPR革命,我们很乐意为这些重要系统的验证提供一个平台。”


原文标题:


CRISPRdisco: An Automated Pipeline for the Discovery and Analysis of CRISPR-Cas Systems.


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