Cell Stem Cell：暨南大学等处首次报道 造血干细胞发育全程单细胞lncRNA动态表达图谱

来自暨南大学基础医学院兰雨课题组、中国医学科学院基础医学研究所余佳课题组、军事医学科学院附属医院（现为解放军总医院第五医学中心）刘兵课题组合作发表研究论文“Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Reveals H19 is Pivotal for Embryonic Hematopoietic Stem Cell Development”，首次报道了造血干细胞发育全程的单细胞长链非编码RNA（lncRNA）动态表达图谱，发现单细胞长链非编码RNA图谱绘制结合功能筛选揭示H19对于造血干细胞发育至关重要。

这一研究成果公布在Cell Stem Cell杂志上，文章第一作者为周杰、张琳琳、徐嘉悦、刘思琪和马艳妮。

研究人员首次报道了造血干细胞发育全程的单细胞长链非编码RNA（lncRNA）动态表达图谱，并鉴定出调控造血干细胞体内产生的重要功能lncRNA分子，这是继2016年刘兵、汤富酬课题组合作采用单细胞孵育诱导移植，成功实现了单个造血干细胞前体（pre-hematopoietic stem cell，pre-HSC）的高效捕获，同时联合单细胞转录组测序技术，系统揭示了造血干细胞发育全程的分子特征（Nature，2016）之后，在造血干细胞发育调控领域的又一项重要的研究进展。

研究首次描绘出造血干细胞发育全程的单细胞lncRNA分子动态表达图谱。系统揭示了lncRNA的时空表达特征、与蛋白编码基因（mRNA）的表达相关性、进化保守特征，同时发现lncRNA相较于mRNA能更好的甄别不同时空造血干细胞相关群体的异质性，并通过与重要mRNA的共定位、共表达分析进行了lncRNA功能预测。

进而，研究人员通过深入分析及体外功能实验筛选出6个可能在胚胎造血发育中发挥作用的lncRNA。利用条件基因敲除策略，进一步阐明了lncRNA-H19对于AGM区HSC发生的重要作用。机制上，lncRNA-H19的缺失使得重要造血转录因子（包括Runx1及Spi1等）的启动子区域高甲基化以致表达下调，最终导致血管内皮细胞向造血干细胞前体转化严重阻滞。

这项研究将为全面理解lncRNA调控重要生物学过程的机制提供重要启示；造血干细胞发育全程的单细胞lncRNA图谱也将为发育和再生研究提供基础性的数据和参考。

原文标题：

Combined Single-Cell Profiling of lncRNAs and Functional Screening Reveals H19 is Pivotal for Embryonic Hematopoietic Stem Cell Development

https://doi.org/ 10.1016/j.stem.2018.11.023

转载标题：Cell Stem Cell：暨南大学等处首次报道造血干细胞发育全程单细胞lncRNA动态表达图谱

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