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MIT、Harvard和Editas等发表有关CRISPR的近期新看点

日期: 2019年06月25日


    

麻省理工学院、哈佛大学和Editas等其他机构在《The CRISPR Journal》发表的新文章概览:

 

1.利用CRISPR-Cas13快速、便携式地检测植物基因的SHERLOCK

核酸检测系统在农业中的应用使性状筛选在育种、害虫监测和病原鉴定中成为可能。来自Broad研究所的张峰团队和Sherlock Biosciences联合创始人们为农业应用重新目的化了他们的SHERLOCK CRISPR-Cas13检测系统。SHERLOCKv2平台结合了相同样本多路复用、横向流视觉读数、定量和信号检测放大。利用改进工具对大豆混合物中的草甘膦抗性基因进行定量分析,并在一个反应中检测到了多种除草剂抗性基因和本地植物基因。这项标榜速度、便携性和最少样品制备的技术对大范围田野基本特征检测将起到推动作用。

通讯作者:Feng Zhang、Omar Abudayyeh和Jonathan Gootenberg

 

2.预测Cas9特异性的条形码库

CRISPR-Cas9技术的一个缺点是它有可能在与目标不匹配的序列上产生意想不到的基因组断裂。这对基于CRISPR的治疗尤其令人关注,在治疗中,人们最不期望看到的就是脱靶。如今,科学家们在全面了解CRISPR核酸酶特异性方面已经作出了相当大的努力,然而,这些方法都没有提供一个根据靶标序列和引导RNA(gRNA)准确预测CRISPR核酸酶切割性能的模型。在这期《The CRISPR Journal》,来自Editas Medicine的研究人员开发了一种基于库的生化分析方法,通过在一系列不匹配的库成员中测量未切割和切割的靶分子,直接报告特定Cas9引导复合体的切割效率。这是基于gRNAS的第一个脱靶计算机模型。他们的方法快速且能够生成蛋白质和引导导向的预测,同时报告Cas9结合与切割的生物物理学。

通讯作者:Barrett Steinberg

 

3.CRISPR通行道路的妥协

当研究人员回忆起十年前的下一代测序,不禁联想到发展应用速度更为惊人的CRISPR。尽管,CRISPR无疑是一种改变游戏规则的生物工程方法,但必须承认该技术仍处于初级阶段,因此横沟依然存在。基因编辑公司Inscripta的数据科学执行董事Richard Fox在《The CRISPR Journal》上讨论了为充分发挥这项突破性技术的潜力,解决CRISPR基因编辑现有局限性的重要性。

通讯作者:Richard Fox

 

4.科学人权:生殖系工程立法评估

人类生殖系工程及其国际规范已成为近年来备受争议的话题。在一个新视角下,Andrea Boggio及其同事根据人权法评估了18个国家关于生殖系工程的国家立法。目前,国际上还没有就如何监管生殖系工程达成共识,现有的国家立法未能提供在CRISPR时代监管生殖系工程所需的治理框架。作者主张将科学人权作为在国家和国际两级就促进负责任的科学和技术进步的管理原则达成共识的起点。

通讯作者:Andrea Boggio

 

5.给基因组编辑手指:Dana Carroll访谈

生物化学家Dana Carroll对锌指核酸酶的开发起到了重要作用,锌指核酸酶基因组编辑是CRISPR-Cas技术的前身。尽管Carroll于2018关闭了他在犹他大学的实验室,但他仍然是基因组编辑的奠基人,比如领导旧金山创新基因组研究所( Innovative Genomics Institute)工作。Carroll最近接收CRISPR杂志执行编辑Kevin Davies专访,在专访中回顾了20年来基因组编辑的研究进展以及目前影响科学界的问题。

通讯作者:Kevin Davies

 

转载标题:MIT、Harvard和Editas等发表有关CRISPR的近期新看点

 

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