PNAS:蛋白质组学可用于致癌突变分析

日期: 2018年04月20日


    

导读:尽管目前还没有药物可以针对RAS突变,但美国西北大学的研究人员利用自上而下的蛋白质组学来鉴定KRAS蛋白质的形式,希望能够为疗法开发打通道路。这项成果于本周发表在《PNAS》上。赛业小编为您推荐“PNAS:蛋白质组学可用于致癌突变分析”,详情如下:


RAS基因有一个开关来控制细胞增殖。如果该基因不幸发生突变,始终停留在“开”的位置上,那么就会导致下游通路的异常调节,促进细胞增殖和肿瘤发生,从而推动癌症发展,并影响治疗效果。


尽管目前还没有药物可以针对这种突变,但美国西北大学的研究人员利用自上而下的蛋白质组学来鉴定KRAS蛋白质的形式,希望能够为疗法开发打通道路。这项成果于本周发表在《PNAS》上。


RAS基因家族包括KRAS、HRAS和NRAS,它们是第一批确定的人类癌细胞中的癌症基因,但是以它们为靶点的治疗仍然难以捉摸。据美国国家癌症研究所(NCI)统计,RAS家族占全部人类癌症的30%,尤其在胰腺癌和结肠直肠癌中非常普遍。带有RAS家族突变的癌症也相当难治疗。


之前分析RAS蛋白质的方法是将它们打断,然 后分析这些碎片。这种技术存在局限性,因为蛋白质需要最终拼接在一起,这使得相似的蛋白质难以鉴定。


为了克服这个难题,研究人员利用免疫亲和富集和自上而下(top-down)的质谱技术来分析正常和突变的KRAS蛋白质,以定量KRAS4b的蛋白质变体。


通过这种技术,研究人员分析了KRAS结直肠癌细胞系和KRAS基因型匹配的结直肠癌肿瘤。他们观察到完整的蛋白质,并发现了遗传编码的突变如何影响同一蛋白分子上的翻译后修饰(PTM)。


他们发现了激活KRAS或干扰膜附着的修饰,揭示了控制下游KRAS活性的细胞机制。


研究人员认为,这种自上而下的蛋白质组学方法能够区分野生型和突变型的KRAS蛋白质,并有望将个体的KRAS蛋白质变体与疾病阶段和生存机会相关联。


原文检索


Precise characterization of KRAS4b proteoforms in human colorectal cells and tumors reveals mutation/modification cross-talk


PNAS April 17, 2018. 115 (16) 4140-4145

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